MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Helicobacter pylori India7 chromosome

Total Repeats: 35087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017372	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	385219874
2	NC_017372	TGA	3	9	121	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219874
3	NC_017372	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	385219874
4	NC_017372	AAAGCG	2	12	288	299	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385219874
5	NC_017372	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219874
6	NC_017372	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	385219874
7	NC_017372	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	385219874
8	NC_017372	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219874
9	NC_017372	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385219874
10	NC_017372	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	385219874
11	NC_017372	CAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385219875
12	NC_017372	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	385219875
13	NC_017372	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385219875
14	NC_017372	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385219875
15	NC_017372	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	385219875
16	NC_017372	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219875
17	NC_017372	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	385219875
18	NC_017372	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219875
19	NC_017372	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	385219876
20	NC_017372	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385219876
21	NC_017372	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385219876
22	NC_017372	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385219876
23	NC_017372	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385219876
24	NC_017372	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385219876
25	NC_017372	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	385219876
26	NC_017372	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	385219876
27	NC_017372	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	385219876
28	NC_017372	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385219876
29	NC_017372	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	385219876
30	NC_017372	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	385219876
31	NC_017372	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219876
32	NC_017372	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219876
33	NC_017372	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219876
34	NC_017372	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219877
35	NC_017372	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	385219877
36	NC_017372	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	385219877
37	NC_017372	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	385219877
38	NC_017372	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	385219877
39	NC_017372	TTAT	2	8	1856	1863	25 %	75 %	0 %	0 %	385219877
40	NC_017372	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	385219877
41	NC_017372	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219877
42	NC_017372	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	385219877
43	NC_017372	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219877
44	NC_017372	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385219877
45	NC_017372	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385219877
46	NC_017372	TGAAT	2	10	2057	2066	40 %	40 %	20 %	0 %	385219877
47	NC_017372	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385219877
48	NC_017372	ATA	2	6	2132	2137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385219877
49	NC_017372	G	6	6	2189	2194	0 %	0 %	100 %	0 %	385219877
50	NC_017372	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	385219877
51	NC_017372	A	8	8	2542	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	385219878
52	NC_017372	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	385219878
53	NC_017372	T	7	7	2638	2644	0 %	100 %	0 %	0 %	385219878
54	NC_017372	TGA	2	6	2663	2668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219878
55	NC_017372	T	7	7	2680	2686	0 %	100 %	0 %	0 %	385219878
56	NC_017372	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385219878
57	NC_017372	GC	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	385219878
58	NC_017372	AAC	2	6	2798	2803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385219878
59	NC_017372	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	385219878
60	NC_017372	AG	3	6	2948	2953	50 %	0 %	50 %	0 %	385219878
61	NC_017372	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385219878
62	NC_017372	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219878
63	NC_017372	AAG	2	6	3094	3099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219878
64	NC_017372	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385219878
65	NC_017372	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385219878
66	NC_017372	TGC	2	6	3218	3223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385219879
67	NC_017372	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	385219879
68	NC_017372	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	385219879
69	NC_017372	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	385219879
70	NC_017372	ATGA	2	8	3471	3478	50 %	25 %	25 %	0 %	385219879
71	NC_017372	GGT	2	6	3578	3583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385219879
72	NC_017372	GCGATA	2	12	3727	3738	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385219879
73	NC_017372	AGAA	2	8	3779	3786	75 %	0 %	25 %	0 %	385219879
74	NC_017372	A	6	6	3867	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	385219879
75	NC_017372	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385219879
76	NC_017372	TAG	2	6	3976	3981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219879
77	NC_017372	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017372	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017372	TGG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017372	TGG	2	6	4298	4303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017372	GTG	2	6	4414	4419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017372	ACC	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017372	GGT	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017372	A	7	7	4580	4586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017372	T	8	8	4600	4607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017372	AAT	2	6	4621	4626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017372	GAAAC	2	10	4650	4659	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017372	TGT	2	6	4754	4759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017372	ATT	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017372	A	6	6	4847	4852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017372	A	6	6	4863	4868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017372	ATTTT	2	10	4893	4902	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017372	TTTTA	2	10	4926	4935	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017372	TC	3	6	4971	4976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017372	A	7	7	5006	5012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017372	T	7	7	5017	5023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017372	A	6	6	5060	5065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017372	TCA	2	6	5082	5087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017372	A	6	6	5096	5101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017372	A	9	9	5110	5118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017372	AGAA	2	8	5131	5138	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017372	A	6	6	5145	5150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017372	GCTT	2	8	5328	5335	0 %	50 %	25 %	25 %	385219880
104	NC_017372	T	6	6	5334	5339	0 %	100 %	0 %	0 %	385219880
105	NC_017372	CATT	2	8	5399	5406	25 %	50 %	0 %	25 %	385219880
106	NC_017372	ATT	2	6	5421	5426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385219880
107	NC_017372	A	6	6	5631	5636	100 %	0 %	0 %	0 %	385219880
108	NC_017372	C	6	6	5651	5656	0 %	0 %	0 %	100 %	385219880
109	NC_017372	A	6	6	5673	5678	100 %	0 %	0 %	0 %	385219880
110	NC_017372	GTT	2	6	5721	5726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219880
111	NC_017372	TAA	2	6	5790	5795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385219880
112	NC_017372	TTA	2	6	5848	5853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385219880
113	NC_017372	GTG	2	6	5917	5922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385219880
114	NC_017372	GTT	2	6	5937	5942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219880
115	NC_017372	CGTG	2	8	5976	5983	0 %	25 %	50 %	25 %	385219880
116	NC_017372	C	6	6	6083	6088	0 %	0 %	0 %	100 %	385219880
117	NC_017372	GTT	2	6	6093	6098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219880
118	NC_017372	AGT	2	6	6149	6154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219880
119	NC_017372	TTTGA	2	10	6192	6201	20 %	60 %	20 %	0 %	385219880
120	NC_017372	GCTTGC	2	12	6223	6234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385219880
121	NC_017372	AGA	2	6	6270	6275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219880
122	NC_017372	GCG	2	6	6296	6301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385219880
123	NC_017372	CGA	2	6	6344	6349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385219880
124	NC_017372	GCTT	2	8	6519	6526	0 %	50 %	25 %	25 %	385219880
125	NC_017372	TGT	2	6	6578	6583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219880
126	NC_017372	ATT	2	6	6606	6611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385219880
127	NC_017372	CAG	2	6	6671	6676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385219880
128	NC_017372	TTTG	2	8	6677	6684	0 %	75 %	25 %	0 %	385219880
129	NC_017372	TGT	2	6	6722	6727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219880
130	NC_017372	TTG	2	6	6762	6767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219880
131	NC_017372	TGGT	2	8	6876	6883	0 %	50 %	50 %	0 %	385219880
132	NC_017372	CCGTTC	2	12	6919	6930	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385219880
133	NC_017372	CCG	2	6	6971	6976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385219880
134	NC_017372	ATCG	2	8	7059	7066	25 %	25 %	25 %	25 %	385219880
135	NC_017372	ATTG	2	8	7071	7078	25 %	50 %	25 %	0 %	385219880
136	NC_017372	GCT	2	6	7086	7091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385219880
137	NC_017372	CGTT	2	8	7094	7101	0 %	50 %	25 %	25 %	385219880
138	NC_017372	GTT	2	6	7116	7121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219880
139	NC_017372	A	6	6	7233	7238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017372	GA	7	14	7272	7285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017372	T	6	6	7296	7301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017372	AAATT	2	10	7317	7326	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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413	NC_017372	GGC	2	6	20364	20369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385219891
414	NC_017372	AGTTTT	2	12	20400	20411	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385219891
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452	NC_017372	A	6	6	22574	22579	100 %	0 %	0 %	0 %	385219893
453	NC_017372	CAC	2	6	22581	22586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385219893
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